Protein–RNA interactions for Protein: Q7L523

RRAGA, Ras-related GTP-binding protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGAQ7L523 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGAQ7L523 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGAQ7L523 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RRAGAQ7L523 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGAQ7L523 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGAQ7L523 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGAQ7L523 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGAQ7L523 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRAGAQ7L523 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms