Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RFLNAQ6ZTI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFLNAQ6ZTI6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFLNAQ6ZTI6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RFLNAQ6ZTI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFLNAQ6ZTI6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFLNAQ6ZTI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFLNAQ6ZTI6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFLNAQ6ZTI6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms