Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COLCA1Q6ZS62 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COLCA1Q6ZS62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLCA1Q6ZS62 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLCA1Q6ZS62 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLCA1Q6ZS62 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COLCA1Q6ZS62 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLCA1Q6ZS62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COLCA1Q6ZS62 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLCA1Q6ZS62 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms