Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2EQ6VUC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2EQ6VUC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAP2EQ6VUC0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAP2EQ6VUC0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms