Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP26C1Q6V0L0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP26C1Q6V0L0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP26C1Q6V0L0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CYP26C1Q6V0L0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP26C1Q6V0L0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms