Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO4Q6UY18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINGO4Q6UY18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LINGO4Q6UY18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINGO4Q6UY18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LINGO4Q6UY18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO4Q6UY18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms