Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP12Q6UXS9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP12Q6UXS9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP12Q6UXS9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP12Q6UXS9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP12Q6UXS9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms