Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLN3Q6UW01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLN3Q6UW01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLN3Q6UW01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLN3Q6UW01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBLN3Q6UW01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBLN3Q6UW01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBLN3Q6UW01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms