Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETSATQ6NUM9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RETSATQ6NUM9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETSATQ6NUM9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RETSATQ6NUM9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETSATQ6NUM9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RETSATQ6NUM9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETSATQ6NUM9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETSATQ6NUM9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETSATQ6NUM9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms