Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
APOBEC3HQ6NTF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
APOBEC3HQ6NTF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
APOBEC3HQ6NTF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
APOBEC3HQ6NTF7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
APOBEC3HQ6NTF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
APOBEC3HQ6NTF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
APOBEC3HQ6NTF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
APOBEC3HQ6NTF7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
APOBEC3HQ6NTF7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
APOBEC3HQ6NTF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
APOBEC3HQ6NTF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms