Protein–RNA interactions for Protein: Q6N043

ZNF280D, Zinc finger protein 280D, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280DQ6N043 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF280DQ6N043 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF280DQ6N043 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF280DQ6N043 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF280DQ6N043 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF280DQ6N043 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF280DQ6N043 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms