Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL6Q6ICC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL6Q6ICC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL6Q6ICC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL6Q6ICC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTL6Q6ICC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL6Q6ICC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms