Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARD17Q5XLA6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD17Q5XLA6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CARD17Q5XLA6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CARD17Q5XLA6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD17Q5XLA6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms