Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LYSMD4Q5XG99 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LYSMD4Q5XG99 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LYSMD4Q5XG99 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LYSMD4Q5XG99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LYSMD4Q5XG99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LYSMD4Q5XG99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LYSMD4Q5XG99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms