Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX4IPQ5VYV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4IPQ5VYV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLX4IPQ5VYV7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX4IPQ5VYV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms