Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSBN1Q5VWQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSBN1Q5VWQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSBN1Q5VWQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSBN1Q5VWQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms