Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACHD1Q5VU97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACHD1Q5VU97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CACHD1Q5VU97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACHD1Q5VU97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
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