Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF38BQ5VTL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRPF38BQ5VTL8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF38BQ5VTL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38BQ5VTL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF38BQ5VTL8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF38BQ5VTL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF38BQ5VTL8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms