Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC158Q5M9N0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC158Q5M9N0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC158Q5M9N0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC158Q5M9N0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC158Q5M9N0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC158Q5M9N0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CCDC158Q5M9N0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms