Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP78Q5JTW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP78Q5JTW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP78Q5JTW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP78Q5JTW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms