Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XKR4Q5GH76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
XKR4Q5GH76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XKR4Q5GH76 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XKR4Q5GH76 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XKR4Q5GH76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XKR4Q5GH76 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
XKR4Q5GH76 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms