Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NOM1Q5C9Z4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NOM1Q5C9Z4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NOM1Q5C9Z4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NOM1Q5C9Z4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NOM1Q5C9Z4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NOM1Q5C9Z4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms