Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDK2Q58EX2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDK2Q58EX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDK2Q58EX2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDK2Q58EX2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDK2Q58EX2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms