Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM3Q53FZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM3Q53FZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSM3Q53FZ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM3Q53FZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSM3Q53FZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms