Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4orf17Q53FE4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4orf17Q53FE4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf17Q53FE4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf17Q53FE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf17Q53FE4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms