Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R8

SLC22A6, Solute carrier family 22 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A6Q4U2R8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC22A6Q4U2R8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A6Q4U2R8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A6Q4U2R8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A6Q4U2R8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms