Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BBS9Q3SYG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS9Q3SYG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBS9Q3SYG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BBS9Q3SYG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BBS9Q3SYG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBS9Q3SYG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BBS9Q3SYG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms