Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V0

MS4A18, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 18, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A18Q3C1V0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A18Q3C1V0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A18Q3C1V0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A18Q3C1V0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A18Q3C1V0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms