Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC6LQ2NKX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6LQ2NKX8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC6LQ2NKX8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6LQ2NKX8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6LQ2NKX8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms