Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KRT24Q2M2I5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KRT24Q2M2I5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
KRT24Q2M2I5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KRT24Q2M2I5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KRT24Q2M2I5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT24Q2M2I5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KRT24Q2M2I5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT24Q2M2I5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT24Q2M2I5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT24Q2M2I5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KRT24Q2M2I5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms