Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN21Q16825 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN21Q16825 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN21Q16825 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN21Q16825 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN21Q16825 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN21Q16825 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
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