Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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