Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3R2Q15599 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R2Q15599 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R2Q15599 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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