Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF4Q15306 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF4Q15306 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF4Q15306 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF4Q15306 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF4Q15306 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF4Q15306 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF4Q15306 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF4Q15306 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF4Q15306 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRF4Q15306 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF4Q15306 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF4Q15306 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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