Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD1Q15116 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD1Q15116 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD1Q15116 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD1Q15116 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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