Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RAB3GAP1Q15042 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAB3GAP1Q15042 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAB3GAP1Q15042 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAB3GAP1Q15042 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAB3GAP1Q15042 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
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