Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAM2Q15035 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAM2Q15035 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAM2Q15035 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM2Q15035 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms