Protein–RNA interactions for Protein: Q15005

SPCS2, Signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2Q15005 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPCS2Q15005 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPCS2Q15005 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPCS2Q15005 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPCS2Q15005 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPCS2Q15005 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPCS2Q15005 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
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