Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D2Q14995 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR1D2Q14995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D2Q14995 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1D2Q14995 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1D2Q14995 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms