Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMCO1Q147U7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMCO1Q147U7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO1Q147U7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO1Q147U7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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