Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAPQ14761 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCAPQ14761 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAPQ14761 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCAPQ14761 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCAPQ14761 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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