Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ZNF598-205ENST00000564556 889 ntTSL 320.8■□□□□ 0.922e-7■■■■□ 25.8
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PUM1Q14671 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 520.43■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CBS-206ENST00000441030 819 ntTSL 519.86■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 218.56■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SERPINH1-214ENST00000533449 582 ntTSL 318.34■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SERPINH1-206ENST00000526242 474 ntTSL 418.1■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CBS-212ENST00000470912 894 ntTSL 318.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 217.88■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 25.8
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PUM1Q14671 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CBS-209ENST00000461686 2656 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PRKDC-203ENST00000432581 583 ntTSL 216.31■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 25.8
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PUM1Q14671 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 516.23■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PLEKHH3-207ENST00000591490 4339 ntTSL 216.22■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 315.96■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AC074143.1-202ENST00000518753 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.52■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-210ENST00000491313 1919 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 DGCR8-206ENST00000485802 555 ntTSL 515.06■□□□□ 02e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 ARHGAP4-209ENST00000422918 642 ntTSL 514.86□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 ZNF598-208ENST00000567008 815 ntTSL 214.23□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 DGCR8-208ENST00000495351 508 ntTSL 414□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PHACTR4-206ENST00000632421 3375 ntTSL 211.58□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 ACTN1-208ENST00000553370 605 ntTSL 310.78□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-210ENST00000475350 1213 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PHACTR4-204ENST00000493669 3078 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-208ENST00000487612 459 ntTSL 310.13□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-201ENST00000324379 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-204ENST00000372835 842 ntTSL 310□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-207ENST00000479481 3271 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-212ENST00000482751 2564 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-209ENST00000474804 793 ntTSL 57.99□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 25.8
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PUM1Q14671 PPIE-215ENST00000497370 913 ntTSL 57.78□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PPIE-214ENST00000495526 4651 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.38e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.388e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.58e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.638e-8■■■■□ 25.8
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PUM1Q14671 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SYNGR2-204ENST00000589168 2125 ntTSL 217.31■□□□□ 0.362e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 SYNGR2-209ENST00000592456 3036 nt11.7□□□□□ -0.542e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 MKNK2-203ENST00000585667 870 ntTSL 523.69■■□□□ 1.385e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 219.05■□□□□ 0.645e-8■■■■□ 25.8
PUM1Q14671 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 25.6
PUM1Q14671 ZC3H18-210ENST00000567085 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.96□□□□□ -0.658e-7■■■■□ 25.6
PUM1Q14671 SEPT5-215ENST00000490204 774 ntTSL 521.53■■□□□ 1.041e-7■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 YIPF4-204ENST00000495355 544 ntTSL 219.25■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.444e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 317.51■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-207ENST00000460031 2726 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 WDR12-206ENST00000477723 706 ntTSL 315.88■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-214ENST00000495874 2813 ntTSL 215.19■□□□□ 0.024e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 XRCC5-204ENST00000429133 576 ntTSL 414.22□□□□□ -0.134e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.344e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.364e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.414e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM96A-205ENST00000559705 636 ntTSL 312.43□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 AKAP8-204ENST00000598597 3071 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-6■■■■□ 25.4
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