Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERV3-1Q14264 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERV3-1Q14264 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERV3-1Q14264 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERV3-1Q14264 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms