Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL9A2Q14055 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A2Q14055 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL9A2Q14055 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL9A2Q14055 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL9A2Q14055 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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