Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CDK13Q14004 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CDK13Q14004 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CDK13Q14004 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CDK13Q14004 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CDK13Q14004 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CDK13Q14004 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CDK13Q14004 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CDK13Q14004 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CDK13Q14004 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CDK13Q14004 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CDK13Q14004 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CDK13Q14004 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CDK13Q14004 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CDK13Q14004 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
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