Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FHL3Q13643 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FHL3Q13643 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FHL3Q13643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FHL3Q13643 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FHL3Q13643 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FHL3Q13643 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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