Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDGQ13569 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDGQ13569 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDGQ13569 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDGQ13569 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDGQ13569 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TDGQ13569 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDGQ13569 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDGQ13569 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDGQ13569 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDGQ13569 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDGQ13569 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDGQ13569 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TDGQ13569 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDGQ13569 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDGQ13569 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDGQ13569 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDGQ13569 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDGQ13569 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDGQ13569 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDGQ13569 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TDGQ13569 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TDGQ13569 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDGQ13569 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDGQ13569 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDGQ13569 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDGQ13569 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDGQ13569 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDGQ13569 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDGQ13569 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDGQ13569 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDGQ13569 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDGQ13569 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDGQ13569 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDGQ13569 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDGQ13569 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDGQ13569 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDGQ13569 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDGQ13569 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TDGQ13569 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDGQ13569 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDGQ13569 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDGQ13569 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDGQ13569 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TDGQ13569 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDGQ13569 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDGQ13569 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDGQ13569 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDGQ13569 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDGQ13569 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDGQ13569 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDGQ13569 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDGQ13569 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDGQ13569 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDGQ13569 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDGQ13569 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDGQ13569 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDGQ13569 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TDGQ13569 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TDGQ13569 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDGQ13569 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDGQ13569 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDGQ13569 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDGQ13569 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDGQ13569 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDGQ13569 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDGQ13569 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDGQ13569 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDGQ13569 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDGQ13569 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDGQ13569 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDGQ13569 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDGQ13569 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDGQ13569 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDGQ13569 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDGQ13569 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDGQ13569 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDGQ13569 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDGQ13569 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDGQ13569 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDGQ13569 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDGQ13569 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDGQ13569 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDGQ13569 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDGQ13569 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDGQ13569 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TDGQ13569 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDGQ13569 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDGQ13569 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDGQ13569 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms