Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NAB1Q13506 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NAB1Q13506 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NAB1Q13506 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NAB1Q13506 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NAB1Q13506 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAB1Q13506 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms