Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
XRCC4Q13426 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC4Q13426 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC4Q13426 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XRCC4Q13426 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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