Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL49Q13405 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL49Q13405 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL49Q13405 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL49Q13405 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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